蚌埠市蚌山区人民法院内设七个审判业务庭和两个综合部门。其职能如下：

（一）立案庭（诉讼服务中心）

对本院依法审理的各类案件进行登记立案和流程管理；依法审查诉前或庭审前财产保全申请并作出裁定；负责各类案件立案阶段的审理调解工作；负责诉讼服务中心事务性工作；负责司法鉴定、评估、拍卖工作；负责信访接待工作及涉诉信访处理；协助、指导人民调解工作；完成院长交办的其他工作。

（二）刑事审判庭

依法审判一审公诉、自诉的各类刑事案件及刑事再审案件；办理其他有关刑事审判工作事宜；完成院长交办的其他工作。

（三）民事审判第一庭（环境资源审判庭）

依法审判第一审婚姻、家庭、继承、损害赔偿、债权债务、劳动争议、人身权、房地产等民事案件及民事再审案件；依法审理涉及环境资源类民事案件和环境公益诉讼案件；完成院长交办的其他工作。

（四）民事审判第二庭

依法审判第一审合同、证券、票据、联营、承包、租赁经营等民事案件及民事再审案件；完成院长交办的其他工作。

（五）行政审判庭（综合审判庭）

依法审判第一审行政案件及行政再审案件；审查行政机关申请强制执行案件；依法办理本院作为赔偿义务机关的案件和上级法院交办的案件；负责上级法院交办的相关行政审判事宜；完成院长交办的其他工作。

（六）执行局（执行庭）

执行本院一审生效法律文书；执行法律规定应由本院执行的其他生效法律文书；办理本院其他执行工作；办理上级法院交办的执行工作；完成院长交办的其他工作。

执行局为副科级。

（七）审判管理办公室（研究室）

负责全院案件管理、司法统计、文书上网、司法公开、司法宣传等工作；负责本院审判工作的宏观调查研究，总结审判工作经验；负责本院论文、案例、司法建议征集、信息报送、门户网站、微信微博管理及网络舆情监测；完成院长交办的其他工作。

（八）政治部

承担机构编制、人事管理、离退休人员服务；负责队伍建设工作；负责人民陪审员的选任工作；参与组织部门考察协管干部人选；负责在职人员岗位业务培训；负责本院法官等级、法官助理职务晋升、法警警衔的评定管理等工作；完成院长交办的其他工作。                             

（九）综合办公室（司法警察大队）

负责文电、会议、机要、保密、档案、宣传、信息化等机关日常运转和综合协调工作；组织办理人大代表建议、政协委员提案及督察工作；承担财务、资产、车辆管理等后勤服务工作；负责专项物资装备管理、审判法庭建设、维护与管理；负责本院诉讼费的收取及行政、业务经费的管理和使用等工作；负责组织落实司法警察工作条例和规章制度；配合执行庭（局）执行有关事项；负责本院武器、警械等专项装备的管理；负责本院机关安全保卫、消防、法庭警卫、被告人看管押解、维护机关秩序；完成院长交办的其他工作。